三叉神経通の発症には様々な疾患が考えられますが､脳幹部に発生した腫瘍､脳動脈瘤による神経の圧迫､多発性硬化症の症状､帯状疱疹の後遺症等､中枢に何らかの既往症があるケースを除いては､その原因は不明で明確に特定出来ない場合が殆どです。

臨床経験的には三叉神経痛の患者さんには精神的､肉体的に何らかの過度のストレスを抱えておられる症例が多く見うけられます。 過度のストレスが交感神経(身体活動を活発にさせる時に働く神経)を必要以上に刺激し､副交感神経(身体活動を落ち着かせている時に働く神経)とのバランスを欠き､緊張と緩和の調整が正常に機能しない状態(自律神経失調状態)を引き起こす場合があることは既に周知されています。

疾病の中にはこの自律神経失調状態が続くことが原因と考えられる症例が多くあり､個々の体質･体調･食生活などの要因により､例えば､円形脱毛症､鬱病､拒食症などの症状として表れ、三叉神経痛の発症の一因もこの症状の一つだと言えます。 つまり､身体器官のどこかに器質的な異常が発生しているのではなく､身体を正常に働かせる機能そのものに難がある疾患と言えます。